Руководитель: Бутовский Руслан Олегович, доктор биологических наук, профессор
Тел.: (495) 423 03 22

Руководитель: Алексей Александрович Шамшин, кандидат биологических наук
Тел.: 495) 423 83 00

Лаборатория экологического аудита, паспортизации и сертификации
Заведующий: Николай Петрович Поляков

Лаборатория экологической экспертизы и оценки воздействия на окружающую среду
Заведующий: 

Руководитель: Сорокин Александр Григорьевич, кандидат биологических наук
Тел.: (495) 423 82 22

Лаборатория охраны редких видов животных
Заведующий лабораторией:

Лаборатория Красной книги
Заведующий лабораторией: Белоусова Анна Вадимовна, кандидат биологических наук

Лаборатория сохранения морских и прибрежных экосистем
Заведующий лабораторией: Беликов Станислав Егорович, кандидат биологических наук, член-корреспондент РАЕН

Сектор редких видов хищных птиц «Русский соколиный центр» (РСЦ)
Заведующий сектором: Бородин Александр Иванович

Генетическая лаборатория
Заведующий лабораторией:

Руководитель: Очагов Дмитрий Михайлович
Заместитель руководителя: Назырова Регина Ильгизовна, кандидат географических наук
Тел.: (495) 423 19 55